INI-1基因编码是一个功能未知的HSWI/SNF染色质重塑复合物蛋白，在恶性横纹肌样瘤(MRT)中容易发生突变和缺失。MRT较髓母细胞瘤和原始神经外胚层肿瘤的总体生存期要低很多，因此，区分MRT与髓母细胞瘤和原始神经瘤和原始神经外胚层肿瘤是很有必要的。INI-1 通常在MRT中缺失表达，而绝大多数髓母细胞瘤和原始外胚层肿瘤都有表达INI1。软组织中的上皮样肉瘤在组织学上经常显示横纹肌样特征，而且都不表达INI-1，有时很难将两者区分，然而上皮样肉瘤CD34和B-catenin阳性，MRT两者均阴性。