MSH2基因作为错配修复系统核心成员，与遗传性非息肉病性结直肠癌（HNPCC）密切相关。该基因是大肠杆菌mutS错配修复基因的人类同源基因，其突变可导致特征性的微卫星序列改变（RER+表型）。在大多数微卫星高度不稳定（MSI-H）患者中可检测到MSH2蛋白异常缺失，这一现象与常染色体显性遗传的HNPCC发病机制相关。该MSH2抗体（常与MLH1抗体联用）对HNPCC患者及其家族成员的筛查具有重要价值。值得注意的是，具有微卫星不稳定特征的结肠癌患者比微卫星稳定型患者表现出更好的临床预后。